这是来自实验室的数据，开始做无参转录组第一次尝试，在此记录过程。这个记录会详尽的记录在时间过程中遇到的问题以及一些学习的细节，但是为了避免文章过于冗长，采用了Markdown中插入HTML标签的方式进行折叠，需要查看即点击查看即可。
无参转录组实战case_1
无参转录组分析
这是一篇关于使用Trinity进行无参转录组分析的文章，首先会简单介绍转录组学，接着会介绍Trinity软件的使用，最后会记录相关的下游分析
一、转录组学
概述：
- 转录组广义上指在某一生理条件下，细胞内所有转录组产物的集合，包括：mRNA、ncRNA、rRNA等；狭义上指所有mRNA的集合。
- 转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，主要包括mRNA和ncRNA。
- 转录组具有时间特异性、组织特异性、空间特异性等特点。
| 类型 | 特点 | 分析策略 |
|---|---|---|
| 有参转录组 | 需要所研究的物种有组装注释质量较好基因组序列， 一般来说比对效率达到70%以上才能满足后续分析。 |
比对—定量—差异分析—功能富集分析（下游分析） |
| 无参转录组 | 缺乏相应的质量较高的基因信息，需要从零开始组装分析 | 组装—定量—差异分析—功能富集分析（下游分析） |
下游分析包括：GO基因功能注释、KEGG通路分析、mRNA表达量计算、差异基因筛选、功能和通路富集分析、时间序列分析、共表达网络分析等
Python基础
这是一篇关于python基础知识复习的博客，除了基础之外，还会涉及进阶以及算法设计。
第一部分 Python基础语法
1. 认识Python
1.1. Python简介
Python的创始人为Guido van Rossum
Python 的设计目标：
- 一门简单直观的语言并与主要竞争者一样强大
- 开源，以便任何人都可以为它做贡献
- 代码像纯英语那样容易理解
- 适用于短期开发的日常任务
Python设计哲学
- 优雅、明确、简单
Python开发者的哲学是：用一种方法，最好只有一种方法来做一件事
Python是完全面向对象的语言，在Python中一切皆对象
可扩展性：如果需要一段关键代码运行的更快或者希望某些算法不公开，可以把这部分程序用
C或者C++编写，然后在Python程序中使用它们。
JS学习笔记
第一部分：JS介绍及基础知识
目录
- 初识JavaScript
- 变量和常量的知识
- 基本数据类型
- 运算符
- 基本数据类型间的转换
- 流程控制语句
1. 初识JavaScript
概述：
JavaScript一种直译式脚本语言，是一种动态类型、弱类型、基于原型的语言，内置支持类型。它的解释器被称为JavaScript引擎，为浏览器的一部分，广泛用于客户端的脚本语言，最早是在HTML（标准通用标记语言下的一个应用）网页上使用，用来给HTML网页增加动态功能。
javascript组成
（1）ECMAScript，描述了该语言的语法和基本对象。
（2）文档对象模型（DOM），描述处理网页内容的方法和接口。
（3）浏览器对象模型（BOM），描述与浏览器进行交互的方法和接口
