前言
最近在做毕设内容，也是转录组的基因数据挖掘工作。这个项目题目是：“黄鳍鲷脑组织转录组性别相关功能基因的数据挖掘”。在前面的分析中，我们已经得到了黄鳍鲷的样本的RNA数据，并进行了无参转录组的组装，salmon的定量mapping，R中edgeR的差异分析，得到了差异基因的table文件，并且将这些差异基因进行了blastx到nr数据库的注释工作，得到了nr注释的table文件，有了这些文件后，我们就可以着手筛选我们的目标基因了。当然，另一个工作是对nr的注释结果进行GO、KEGG的注释与富集分析，这个是从整体层面上来了解我们差异分析得到的差异基因的总体情况，与我们现在进行的特定功能的基因的筛选关联性并不密切。